Changeset 1058


Ignore:
Timestamp:
01/08/21 17:54:11 (4 years ago)
Author:
sz
Message:

updated for Framsticks50rc16 (ModelSimilarity? replaced by SimilMeasure? classes)

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • java/Framclipse/com.framsticks.framclipse/res/framscript.xml

    r1042 r1058  
    17221722                        <description><![CDATA[]]></description>
    17231723                </element>
     1724                <element name="f0s_p_rot" type="float" min="0" max="100" default="10.0">
     1725                        <description><![CDATA[]]></description>
     1726                </element>
    17241727                <element name="f0s_p_scale" type="float" min="0" max="100" default="10.0">
    17251728                        <description><![CDATA[]]></description>
    … …  
    17331736                <element name="f0s_p_asm" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    17341737                        <description><![CDATA[The interpretation and influence of this property must be implemented by the experiment definition]]></description>
    1735                 </element>
    1736                 <element name="f0s_p_vsiz" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    1737                         <description><![CDATA[]]></description>
    17381738                </element>
    17391739                <element name="f0s_j_new" type="float" min="0" max="100" default="5.0">
    … …  
    28022802<arguments/></element>
    28032803        </type>
    2804         <type name="ModelSimilarity" context="Global context">
    2805 <description><![CDATA[Evaluates morphological dissimilarity. More information:
    2806 http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-et-al-2001
    2807 http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-and-Kubiak-2011
    2808 http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-2016
    2809 https://doi.org/10.1007/978-3-030-16692-2_8]]></description>
    2810                 <element name="simil_method" type="integer" min="0" max="1" default="0">
    2811                         <description><![CDATA[]]></description>
    2812                 </element>
    2813                 <element name="simil_parts" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    2814                         <description><![CDATA[Differing number of parts is also handled by the 'part degree' similarity component.]]></description>
    2815                 </element>
    2816                 <element name="simil_partdeg" type="float" min="0" max="100" default="1.0">
    2817                         <description><![CDATA[]]></description>
    2818                 </element>
    2819                 <element name="simil_neuro" type="float" min="0" max="100" default="0.1">
    2820                         <description><![CDATA[]]></description>
    2821                 </element>
    2822                 <element name="simil_partgeom" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    2823                         <description><![CDATA[]]></description>
    2824                 </element>
    2825                 <element name="simil_fixedZaxis" type="integer" min="0" max="1" default="0">
    2826                         <description><![CDATA[]]></description>
    2827                 </element>
    2828                 <element name="simil_weightedMDS" type="integer" min="0" max="1" default="0">
    2829                         <description><![CDATA[If activated, weighted MDS with vertex (i.e., Part) degrees as weights is used for 3D alignment of body structure.]]></description>
    2830                 </element>
    2831                 <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
    2832                         <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
    2833                         <arguments>
    2834                                 <argument type="Geno"/>
    2835                                 <argument type="Geno"/>
    2836                         </arguments>
    2837                 </element>
    2838         </type>
    28392804        <type name="ModelSymmetry" context="Global context">
    28402805<description><![CDATA[Calculates bilateral symmetry. Details are described in http://www.framsticks.com/bib/Jaskowski-and-Komosinski-2008]]></description>
    … …  
    49414906                        <description><![CDATA[]]></description>
    49424907                </element>
     4908                <element name="f0s_p_rot" type="float" min="0" max="100" default="10.0">
     4909                        <description><![CDATA[]]></description>
     4910                </element>
    49434911                <element name="f0s_p_scale" type="float" min="0" max="100" default="10.0">
    49444912                        <description><![CDATA[]]></description>
    … …  
    49524920                <element name="f0s_p_asm" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    49534921                        <description><![CDATA[The interpretation and influence of this property must be implemented by the experiment definition]]></description>
    4954                 </element>
    4955                 <element name="f0s_p_vsiz" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    4956                         <description><![CDATA[]]></description>
    49574922                </element>
    49584923                <element name="f0s_j_new" type="float" min="0" max="100" default="5.0">
    … …  
    56565621   time (t) float 0..6.28319 (default 0)]]></description>
    56575622                </element>
    5658                 <element name="simil_method" type="integer" min="0" max="1" default="0">
    5659                         <description><![CDATA[]]></description>
     5623                <element name="type" type="integer" min="0" max="2" default="1">
     5624                        <description><![CDATA[]]></description>
     5625                </element>
     5626                <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
     5627                        <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
     5628                        <arguments>
     5629                                <argument type="Geno"/>
     5630                                <argument type="Geno"/>
     5631                        </arguments>
     5632                </element>
     5633                <element name="simil_greedy_parts" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5634                        <description><![CDATA[Differing number of parts is also handled by the 'part degree' similarity component.]]></description>
     5635                </element>
     5636                <element name="simil_greedy_partdeg" type="float" min="0" max="100" default="1.0">
     5637                        <description><![CDATA[]]></description>
     5638                </element>
     5639                <element name="simil_greedy_neuro" type="float" min="0" max="100" default="0.1">
     5640                        <description><![CDATA[]]></description>
     5641                </element>
     5642                <element name="simil_greedy_partgeom" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5643                        <description><![CDATA[]]></description>
     5644                </element>
     5645                <element name="simil_greedy_fixedZaxis" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5646                        <description><![CDATA[]]></description>
     5647                </element>
     5648                <element name="simil_greedy_weightedMDS" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5649                        <description><![CDATA[If activated, weighted MDS with vertex (i.e., Part) degrees as weights is used for 3D alignment of body structure.]]></description>
    56605650                </element>
    56615651                <element name="simil_parts" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
    … …  
    56775667                        <description><![CDATA[If activated, weighted MDS with vertex (i.e., Part) degrees as weights is used for 3D alignment of body structure.]]></description>
    56785668                </element>
    5679                 <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
    5680                         <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
    5681                         <arguments>
    5682                                 <argument type="Geno"/>
    5683                                 <argument type="Geno"/>
    5684                         </arguments>
     5669                <element name="simil_density" type="float" min="1" max="100" default="10.0">
     5670                        <description><![CDATA[]]></description>
     5671                </element>
     5672                <element name="simil_bin_num" type="integer" min="1" max="1000" default="128">
     5673                        <description><![CDATA[]]></description>
     5674                </element>
     5675                <element name="simil_samples_num" type="integer" min="1" max="1048576" default="1048576">
     5676                        <description><![CDATA[]]></description>
    56855677                </element>
    56865678                <element name="calculateSymmetry" function="true" type="float" flags="32">
    … …  
    57405732                <element name="minjoint" type="float" min="0" max="100" default="0.0"/>
    57415733                <element name="maxjoint" type="float" min="0" max="100" default="2.0"/>
     5734        </type>
     5735        <type name="SimilMeasure" context="Global context">
     5736<description><![CDATA[Evaluates morphological dissimilarity. More information:
     5737http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-et-al-2001
     5738http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-and-Kubiak-2011
     5739http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-2016
     5740https://doi.org/10.1007/978-3-030-16692-2_8]]></description>
     5741                <element name="type" type="integer" min="0" max="2" default="1">
     5742                        <description><![CDATA[]]></description>
     5743                </element>
     5744                <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
     5745                        <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
     5746                        <arguments>
     5747                                <argument type="Geno"/>
     5748                                <argument type="Geno"/>
     5749                        </arguments>
     5750                </element>
     5751        </type>
     5752        <type name="SimilMeasureDistribution" context="Global context">
     5753<description><![CDATA[Evaluates morphological dissimilarity using distribution measure.]]></description>
     5754                <element name="simil_density" type="float" min="1" max="100" default="10.0">
     5755                        <description><![CDATA[]]></description>
     5756                </element>
     5757                <element name="simil_bin_num" type="integer" min="1" max="1000" default="128">
     5758                        <description><![CDATA[]]></description>
     5759                </element>
     5760                <element name="simil_samples_num" type="integer" min="1" max="1048576" default="1048576">
     5761                        <description><![CDATA[]]></description>
     5762                </element>
     5763                <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
     5764                        <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
     5765                        <arguments>
     5766                                <argument type="Geno"/>
     5767                                <argument type="Geno"/>
     5768                        </arguments>
     5769                </element>
     5770        </type>
     5771        <type name="SimilMeasureGreedy" context="Global context">
     5772<description><![CDATA[Evaluates morphological dissimilarity using greedy measure. More information:
     5773http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-et-al-2001
     5774http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-and-Kubiak-2011
     5775http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-2016
     5776https://doi.org/10.1007/978-3-030-16692-2_8]]></description>
     5777                <element name="simil_greedy_parts" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5778                        <description><![CDATA[Differing number of parts is also handled by the 'part degree' similarity component.]]></description>
     5779                </element>
     5780                <element name="simil_greedy_partdeg" type="float" min="0" max="100" default="1.0">
     5781                        <description><![CDATA[]]></description>
     5782                </element>
     5783                <element name="simil_greedy_neuro" type="float" min="0" max="100" default="0.1">
     5784                        <description><![CDATA[]]></description>
     5785                </element>
     5786                <element name="simil_greedy_partgeom" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5787                        <description><![CDATA[]]></description>
     5788                </element>
     5789                <element name="simil_greedy_fixedZaxis" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5790                        <description><![CDATA[]]></description>
     5791                </element>
     5792                <element name="simil_greedy_weightedMDS" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5793                        <description><![CDATA[If activated, weighted MDS with vertex (i.e., Part) degrees as weights is used for 3D alignment of body structure.]]></description>
     5794                </element>
     5795                <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
     5796                        <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
     5797                        <arguments>
     5798                                <argument type="Geno"/>
     5799                                <argument type="Geno"/>
     5800                        </arguments>
     5801                </element>
     5802        </type>
     5803        <type name="SimilMeasureHungarian" context="Global context">
     5804<description><![CDATA[Evaluates morphological dissimilarity using hungarian measure. More information:
     5805http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-et-al-2001
     5806http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-and-Kubiak-2011
     5807http://www.framsticks.com/bib/Komosinski-2016
     5808https://doi.org/10.1007/978-3-030-16692-2_8]]></description>
     5809                <element name="simil_parts" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5810                        <description><![CDATA[Differing number of parts is also handled by the 'part degree' similarity component.]]></description>
     5811                </element>
     5812                <element name="simil_partdeg" type="float" min="0" max="100" default="1.0">
     5813                        <description><![CDATA[]]></description>
     5814                </element>
     5815                <element name="simil_neuro" type="float" min="0" max="100" default="0.1">
     5816                        <description><![CDATA[]]></description>
     5817                </element>
     5818                <element name="simil_partgeom" type="float" min="0" max="100" default="0.0">
     5819                        <description><![CDATA[]]></description>
     5820                </element>
     5821                <element name="simil_fixedZaxis" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5822                        <description><![CDATA[]]></description>
     5823                </element>
     5824                <element name="simil_weightedMDS" type="integer" min="0" max="1" default="0">
     5825                        <description><![CDATA[If activated, weighted MDS with vertex (i.e., Part) degrees as weights is used for 3D alignment of body structure.]]></description>
     5826                </element>
     5827                <element name="evaluateDistance" function="true" type="float" flags="34">
     5828                        <description><![CDATA[Calculates dissimilarity between two models created from Geno objects.]]></description>
     5829                        <arguments>
     5830                                <argument type="Geno"/>
     5831                                <argument type="Geno"/>
     5832                        </arguments>
     5833                </element>
    57425834        </type>
    57435835        <type name="Simulator" context="Global context">
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.