source: framspy/evolalg/run_frams_niching.py @ 1190

Last change on this file since 1190 was 1190, checked in by Maciej Komosinski, 2 years ago

Added the "evolalg" module for evolutionary optimization

File size: 2.3 KB
Line 
1from FramsticksLib import FramsticksLib
2
3from .frams_base.experiment_frams_niching import ExperimentFramsNiching
4
5
6def main():
7    # random.seed(123)  # see FramsticksLib.DETERMINISTIC below, set to True if you want full determinism
8    # must be set before FramsticksLib() constructor call
9    FramsticksLib.DETERMINISTIC = False
10    parsed_args = ExperimentFramsNiching.get_args_for_parser().parse_args()
11    print("Argument values:", ", ".join(
12        ['%s=%s' % (arg, getattr(parsed_args, arg)) for arg in vars(parsed_args)]))
13    # multiple criteria not supported here. If needed, use FramsticksEvolution.py
14    opt_criteria = parsed_args.opt.split(",")
15    framsLib = FramsticksLib(
16        parsed_args.path, parsed_args.lib, parsed_args.sim.split(";"))
17    constrains = {"max_numparts": parsed_args.max_numparts,
18                  "max_numjoints": parsed_args.max_numjoints,
19                  "max_numneurons": parsed_args.max_numneurons,
20                  "max_numconnections": parsed_args.max_numconnections,
21                  "max_numgenochars": parsed_args.max_numgenochars,
22                  }
23
24    print('Best individuals:')
25    experiment = ExperimentFramsNiching(frams_lib=framsLib,
26                                        optimization_criteria=opt_criteria,
27                                        hof_size=parsed_args.hof_size,
28                                        constraints=constrains,
29                                        normalize=parsed_args.normalize,
30                                        dissim=parsed_args.dissim,
31                                        fit=parsed_args.fit,
32                                        genformat=parsed_args.genformat,
33                                        popsize=parsed_args.popsize,
34                                        archive_size=parsed_args.archive,
35                                        save_only_best=parsed_args.save_only_best)
36
37    experiment.evolve(hof_savefile=parsed_args.hof_savefile,
38                      generations=parsed_args.generations,
39                      initialgenotype=parsed_args.initialgenotype,
40                      pmut=parsed_args.pmut,
41                      pxov=parsed_args.pxov,
42                      tournament_size=parsed_args.tournament)
43
44
45if __name__ == "__main__":
46    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.